Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms