Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc8Q8VD72 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc8Q8VD72 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc8Q8VD72 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc8Q8VD72 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc8Q8VD72 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc8Q8VD72 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc8Q8VD72 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc8Q8VD72 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc8Q8VD72 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc8Q8VD72 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ttc8Q8VD72 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ttc8Q8VD72 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc8Q8VD72 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms