Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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