Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms