Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms