Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms