Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c5Q8R2T8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms