Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Hoxc12Q8K5B8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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