Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OptnQ8K3K8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms