Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc12Q8K2L8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc12Q8K2L8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms