Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Nek9Q8K1R7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Nek9Q8K1R7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Nek9Q8K1R7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Nek9Q8K1R7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Nek9Q8K1R7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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