Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg3l2Q8JZQ2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms