Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Brf1Q8CFK2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Brf1Q8CFK2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Brf1Q8CFK2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Brf1Q8CFK2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf1Q8CFK2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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