Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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