Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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