Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Nhlrc3Q8CCH2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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