Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntrobQ8CB62 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntrobQ8CB62 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms