Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8C1

Rtp1, Receptor-transporting protein 1, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp1Q8C8C1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp1Q8C8C1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp1Q8C8C1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp1Q8C8C1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp1Q8C8C1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp1Q8C8C1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp1Q8C8C1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp1Q8C8C1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp1Q8C8C1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp1Q8C8C1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp1Q8C8C1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp1Q8C8C1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtp1Q8C8C1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rtp1Q8C8C1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rtp1Q8C8C1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rtp1Q8C8C1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rtp1Q8C8C1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rtp1Q8C8C1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rtp1Q8C8C1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rtp1Q8C8C1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rtp1Q8C8C1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rtp1Q8C8C1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rtp1Q8C8C1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp1Q8C8C1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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