Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FarsaQ8C0C7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FarsaQ8C0C7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FarsaQ8C0C7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FarsaQ8C0C7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FarsaQ8C0C7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FarsaQ8C0C7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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