Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms