Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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TtpaQ8BWP5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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