Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms