Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp54Q8BL06 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms