Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdca8Q8BHX3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms