Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ubash3bQ8BGG7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ubash3bQ8BGG7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ubash3bQ8BGG7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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