Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M10.4Q85ZW8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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