Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms