Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms