Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnma8aQ80VM8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms