Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
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