Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms