Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmed3Q78IS1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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