Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms