Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
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Nme8Q715T0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nme8Q715T0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nme8Q715T0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nme8Q715T0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nme8Q715T0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nme8Q715T0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme8Q715T0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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