Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt9Q6RHW0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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