Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms