Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms