Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms