Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6DFW0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q6DFW0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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