Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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