Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms