Protein–RNA interactions for Protein: Q61645

Hr, Lysine-specific demethylase hairless, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrQ61645 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HrQ61645 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HrQ61645 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HrQ61645 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HrQ61645 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HrQ61645 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HrQ61645 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HrQ61645 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HrQ61645 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms