Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BcanQ61361 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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BcanQ61361 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms