Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Foxd1Q61345 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Foxd1Q61345 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Foxd1Q61345 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Foxd1Q61345 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Foxd1Q61345 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Foxd1Q61345 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Foxd1Q61345 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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