Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms