Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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