Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms