Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam208bQ5DTT3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms