Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms