Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dnah12Q3V0Q1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dnah12Q3V0Q1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dnah12Q3V0Q1 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dnah12Q3V0Q1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dnah12Q3V0Q1 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Dnah12Q3V0Q1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Dnah12Q3V0Q1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Dnah12Q3V0Q1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnah12Q3V0Q1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms